Annexe — données épidémiques

Ce texte est une annexe à la tribune Covid-19 : « La qualité de l’air à l’intérieur des universités doit être considérée comme un bien commun. » publiée dans Le Monde le 21 juin 2021, et que vous pouvez signer ici.

Nous donnons ici les références et les raisonnements derrière la phrase suivante : « Avec une couverture vaccinale de 60 %, nous serions à la rentrée 2021 globalement dans la même situation vis-à-vis des risques d’une nouvelle flambée épidémique qu’à la rentrée 2020.»

En préambule, rappelons qu’il ne saurait exister de prédiction sur ce qui se produira en septembre, puisque nous appelons précisément à nous donner les moyens qu’il ne se passe rien. Le variant le plus contagieux des trois variants Delta, labellisé B.1.167.2 et appelé improprement “variant indien”, est 66% plus transmissible environ que le variant alpha (labellisé B1.1.7 et popularisé sous le nom “variant anglais”) [2-5]. Le variant alpha était lui-même 77% plus transmissible que la souche de référence (Wuhan-1) [6]. Cette transmissibilité accrue devrait amener le Delta à supplanter les autres variants et devenir la lignée dominante en circulation au cours des prochains mois. En un an, de la souche de référence au variant Delta, la transmissibilité de la souche hégémonique aura crû, en septembre, d’un facteur entre 2 et 3. Le variant Delta est déjà hégémonique en Angleterre, au Portugal et en Russie, et se développe rapidement en Allemagne, en Belgique, en Italie… et en France [7]. 

En considérant la situation idéalisée où le vaccin protégerait non seulement des maladies graves mais aussi de la contamination en voies hautes  [8-10], si 60% de la population est vaccinée, alors le virus se propagerait dans les 40% de population restante. Le taux de reproduction serait donc le taux de reproduction de base R0, autour de 6,5 (2,5 fois plus que la souche de référence), que multiplie la fraction non immunisée de la population, 0,4. L’accroissement en un an de la transmissibilité serait alors compensé par la vaccination, conduisant à une situation globalement identique entre septembre 2021 et septembre 2020. En l’absence de mesure complémentaire, le taux de reproduction du variant Delta serait largement au-dessus de 1, le seuil en dessous duquel l’épidémie s’éteint spontanément. Dans l’autre sens, l’immunité de groupe serait atteinte à une fraction de la population immunisée égale à (1 – 1/Ro)=85%. Le seuil d’immunité de groupe représente le pourcentage de la population qui doit être immunisée pour qu’une personne infectée contamine au plus une autre personne, c’est-à-dire pour faire descendre le taux de reproduction R en-dessous de 1.

La vaccination ne peut donc qu’être un moyen dans un arsenal sanitaire diversifié pour venir à bout de la syndémie et prévenir la possibilité de variants encore plus transmissible, ou disposant d’un échappement immunitaire conséquent.

[2] Les variants b.1.617 dits « indiens », Avis du Conseil scientifique COVID-19, 24 mai 2021.

[3] Public Health England. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation – Technical briefing 15, 11 juin 2021.

[3] Alizon S, Haim-Boukobz S, Foulongne V, et al. Rapid spread of the SARS-CoV-2 δ variant in the area of Paris (France) in June 2021. medRxiv. doi: 0.1101/2021.06.16.21259052, 20 juin 2021.

[4] Une bibliographie complète sur le blog de Marc Gozlan.

[5] Finlay Campbell et al., Increased transmissibility and global spread of SARS-CoV-2 variants of concern as at June 2021. Eurosurveillance 26(24) 2100509, 17juin 2021.

[6] Nicholas G. Davies et al. Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England. Science 372(6538):eabg3055, 9 avril 2021.

[7] Santé Publique France, « COVID-19 – situation hebdomadaire du 17 septembre 2020 ».

[8] Planas D, Veyer D, Baidalluk A, et al. Reduced sensitivity of infectious SARS-CoV-2 variant B.1.617.2 to monoclonal antibodies and sera from convalescent and vaccinated individuals. bioRxiv doi: 10.1101/2021.05.26.445838, 27 mai 2021.

[9] Institut Pasteur. Covid-19 : analyse de la sensibilité du variant indien (B.1.617.2) aux anticorps monoclonaux et aux sérums de personnes ayant été infectées ou vaccinées. 20 mai 2021.

[10] Gozlan, M. Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux. Le Monde, 30 mai 2021